No son infrecuentes la asociación de alteraciones o patologías óseas con las cardiopatías congénitas. Hay veces que ambas lesiones forman parte de síndromes malformativos. Otras veces la cardiopatía y las múltiples operaciones ocasionan las alteraciones óseas.
Dos son las estructuras óseas que más se asocian o afectan en los pacientes con cardiopatía congénita: